恒濕箱系統的運作是通過三個相互聯系的系統：制冷劑循環系統、空氣循環系統、電器自控系統;
.制冷劑循環系統：蒸發器中的液態制冷劑吸收空氣的熱量（空氣被降溫及除濕）并開始蒸發，終制冷劑與空氣之間形成定的溫度差，液態制冷劑亦完全蒸發變為氣態，后被壓縮機吸入并壓縮（壓力和溫度增加）,氣態制冷劑通過冷凝器（風冷/水冷）吸收熱量，凝結成液體。通過膨脹閥節流后變成低溫低壓制冷劑進入蒸發器，完成制冷劑循環過程。
二.空氣環系統：風機負責將空氣從回風口吸入，空氣經過蒸發器（降溫、除濕），加濕器，電加熱器（升溫）后經送風口送到用戶需的箱體內，送出的空氣與箱體內的空氣混合后回到回風口。
三.電器自控系統：電器自控系統包括電源部分和自動控制部分。1.電源部分通過接觸器，對壓縮機、風扇、電加器器，加濕器等供應電源 2.自動控制分部分又分為溫、濕度控制及故障保護部分:1).溫、濕度控制是通過溫、濕度控制器，將回風的溫濕度與用戶設定的溫濕作對比，自動運行壓縮機（降溫、除濕），加濕器，電加熱（升溫）等元件，實現恒溫恒濕的自動控制2).故障保護控制是通過壓力保護、延時器、繼電器、過載保護等相互組合達到，對壓縮機，風機，加濕器等元件進行故障保護的控制恒溫恒濕箱。
